В Nioh Уильям Адамс — светловолосый чужеземец, ставший союзником Иэясу, — попадает в тёмно-фэнтезийную версию 1600 года: демоны в грязи японских междоусобиц, за ними стоит алхимик Эдвард Келли, а над всем поднимается Токугава Иэясу. Сюжет сшит с настоящими местами: от лондонской тюрьмы до поля боя, которое сделало Токугава сёгунами.
Маршрут идёт по основной кампании и двум последним дополнениям: Тауэр, Киото, Сэкигахара, затем Санада-мару, Тэннодзи и замок Осака. Игра — фэнтези, поэтому на карте показано, где происходила история, а не где снимали или с чего моделировали.
Самурайская игра с открытым миром от Team Ninja забрасывает безгосподного Клинка-близнеца в последние годы сёгуната. С 1858 по 1868 год сюжет проходит путь от иностранного квартала Иокогамы через убийство главного министра до киотских Синсэнгуми и заговора с целью сжечь Эдо.
Этот маршрут следует за основным сюжетом игры через семь мест, от порта до столицы, и сопоставляет каждую сцену с настоящим местом, с которым её связывает история. Если игра называет лишь район, метка отмечает ближайшую известную достопримечательность.
В 1581 году африканский раб Диогу приезжает в Киото с иезуитской делегацией и достаётся полководцу Оде Нобунаге, который даёт ему имя Ясукэ и делает его самураем. В тот же год армия Нобунаги громит провинцию ниндзя Ига, где юная синоби Наоэ теряет отца и получает в наследство его Скрытый клинок.
Дальше они вдвоём идут по следу одного заговора через Кансай: порт Сакаи, храм Хонно-дзи, где умирает Нобунага, кофун в Сэтцу, замок Сёрюдзи в Ямадзаки, святилища Ямато и вербовочную базу тамплиеров в Кии. Большинство остановок — настоящие замки, храмы и гробницы, которые воссоздаёт игра.