Veinte años después de una guerra nuclear, los supervivientes de Moscú viven en el metro, y un joven llamado Artyom debe llevar una advertencia desde su estación natal a través de toda la red. La novela y el juego basado en ella usan nombres reales de estaciones, así que se puede seguir el viaje de Artyom en un plano normal de la ciudad.
La ruta va desde VDNKh, en el norte, pasando por Kitay-gorod, Paveletskaya y Kievskaya, hasta la torre de Ostankino. El libro y el juego difieren en algunos puntos; cuando es así, el texto lo señala. La parada de la biblioteca es una coincidencia probable, no un lugar nombrado.
En 2035 Artyom abandona el Metro de Moscú a bordo de un tren robado, el Aurora, y descubre que Rusia, más allá de la ciudad, sigue viva. La secuela de Metro 2033 convierte una historia subterránea de Moscú en un viaje en tren por todo el país.
La ruta sigue el Volga, el Arca de Yamantau, el Caspio y Novosibirsk hasta el lago Baikal. Los lugares del juego son versiones inventadas de los reales, así que cada marcador señala una zona, no un nivel.