Root Letter is set in Matsue, Shimane, and its backdrops copy real places: the Shimane Art Museum, the Kyomise shopping street, Lake Shinji, Yaegaki Shrine and Matsue Castle.
A man travels to Matsue to find Fumino Aya, a pen pal who vanished 15 years earlier, and questions her old classmates one by one. The route follows five real places that the game turns into scenes, from the lakeside city to a shrine tied to the Yamata-no-Orochi legend. The game's order of visits is not documented, so the stops are a sequence, not a timetable.
En mayo de 1804, William Clark y unos 30 hombres más dejaron un campamento de invierno en el Misisipi y remontaron el Misuri, la primera etapa de una expedición enviada a cruzar la parte occidental del país, recién adquirida. Los capitanes Meriwether Lewis y Clark llevaron diarios, y muchas de sus anotaciones se citan aquí con sus propias palabras.
La ruta los sigue desde Camp Dubois, pasando por la tumba de un sargento, un tenso enfrentamiento con los teton sioux, un invierno en Fort Mandan, las Great Falls, la divisoria continental y el sendero Lolo cubierto de nieve, hasta el Pacífico, y luego de vuelta a casa por la firma de Clark en Pompeys Pillar. Cuando un campamento se ha perdido por culpa del río o del tiempo, el marcador señala el lugar visitable más cercano.
