暁人は交通事故のあと、仮面をつけた怪人が放つ霧で人影の消えた渋谷で目を覚ます。彼の体は霊体のKKと共有されており、今や街にあふれるマレビトを見ることができる。タンゴゲームワークスはこの街を、実物そのままではなく、歩いて回れる凝縮された舞台として作った。ランドマークはそのままに、裏通りを借り、東京の別の地区もいくつか織り込んでいる。 このルートは、スクランブル交差点と駅から、センター街、道玄坂、109の代わりとなる建物を抜け、北へ向かって借りてきた谷中銀座へ、そして街を横切って東京タワーの終幕へと、ゲームをたどる。ピンは実在の場所を示しているが、ゲームのマップではそのいくつかが互いに近づけられている。
1937年、「レイダース／失われた聖櫃」と「最後の聖戦」のあいだの時期。巨漢の男がマーシャル大学に押し入り、ミイラ化した猫を盗み出して、インディ・ジョーンズを殴り倒す。手がかりをたどるインディは、地球上に等間隔で並ぶ聖地の連なり「大いなる円環」へとたどり着き、その力を解き放とうとするナチスの考古学者エマーリッヒ・フォスとの競争に巻き込まれる。マシンゲームズの2024年のゲームの物語はトッド・ハワードが着想したもので、ディレクターはそれを「1980年代に作られた幻のインディ・ジョーンズの冒険」として思い描いていた。 円環とその秘密は純然たる冒険フィクションだが、立ち寄る場所は実在する。バチカン、ギザ、戦時下の上海、廃墟となったタイの古都スコータイ、そしてウルのジッグラトだ。デザイナーたちは書物や写真をもとに、1930年代の姿としてそれらを作り直した。このルートはメインストーリーをたどる。