В 2035 году Артём покидает московское метро на угнанном поезде «Аврора» и обнаруживает, что Россия за пределами города всё ещё жива. Продолжение «Метро 2033» превращает московскую подземную историю в железнодорожное путешествие через всю страну.
Маршрут идёт вдоль Волги, к Ковчегу на Ямантау, по Каспию и через Новосибирск к Байкалу. Места в игре — вымышленные версии настоящих, поэтому каждая метка обозначает район, а не уровень.
Русская легенда, которую порой называют русской Атлантидой, рассказывает, что целый город ушёл под воду озера, лишь бы не достаться монголам, и что в тихую погоду там до сих пор слышен колокольный звон. Римский-Корсаков сделал из неё оперу, а Вернер Херцог отправился на поиски Китежа с кинокамерой.
Маршрут идёт по следам сказания: от народной этимологии названия через городок, который считают Малым Китежем, и керженские леса к самому озеру и к петербургской сцене, где впервые прозвучала опера. Китеж — легенда: эти места лишь традиционные отождествления, а не доказательство.
В 1466 или 1468 году тверской купец отправился вниз по Волге торговать в прикаспийских землях. В пути его ограбили, он пересёк Персию, из Ормуза отплыл в Индию и записал увиденное в «Хожении за три моря».
Маршрут идёт за ним от Твери через Дербент, Ормуз и побережье Индии до Бидара, а потом домой; последняя остановка — Кафа на Чёрном море. Даты оспариваются, а большинство остановок обозначено лишь областью, потому что в записях названы города, а не здания.
В 1927 году бывший дворянин и обаятельный авантюрист гоняются по Советскому Союзу за двенадцатью обеденными стульями, в одном из которых спрятаны фамильные драгоценности. Комический роман Ильфа и Петрова ведёт их из сонного провинциального города через Москву и Волгу к курорту Пятигорск, по кавказской дороге и к побережью Крыма.
На маршруте шесть остановок; Старгород и Васюки выдуманы, так что их метки — лишь возможные прототипы.